Vyvrcholením mnohostranné vzdělávací činnosti a výrazným specifikem studia na AG je bohatý systém přibližně 30 volitelných předmětů (tzv. seminářů) určených studentům sext až oktáv: studenti v sextě si musí vybrat aspoň 1 volitelný předmět, v septimě aspoň 2, v oktávě aspoň 4.

Tato široká nabídka umožňuje jednak výrazně profilovat přípravu na vysokoškolské studium, jednak zaměřit se na kombinaci předmětů, kterou tradiční dělení na obory humanitní a přírodovědné takřka vylučuje.

Během seminářových hodin se navíc ruší běžné třídy a studenti se mohou sdružovat na základě podobných zájmů.